Em um programa de TE, existem diversos fatores que podem afetar a sua eficiência. Algumas variáveis importantes as quais o Médico Veterinária que desenvolve reprodução equina deve se atentar são:
- Gestão de doadoras e receptoras
 - Qualidade da receptora
 - Sincronização da ovulação
 - Competências técnicas do operador
 - Métodos utilizados para realizar a TE
 - Qualidade do embrião
 - Condições uterinas das éguas
 - Condições nutricionais das éguas
 - Saúde da receptora pós TE
 
Diante de tantos fatores, será que dá para manejar um programa de TE bem sucedido? Como?
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